Vi anbefaler at du alltid bruker siste versjon av nettleseren din.
logo UNN

Økning av ESBL-CARBA produserende E. coli ST131

Ny studie fra ECDC viser fremvekst av ESBL-CARBA produserende E. coli ST131 i Europa.

Publisert 02.12.2024

I samarbeid med referanselaboratorier i Europa har ECDC nylig publisert en analyse av ESBL-CARBA produserende E. coli ST131 i Europa [1]. E. coli ST131 er en kjent global høy-risiko klon assosiert med multiresistens [2, 3]. Studier via NORM og Tromsøundersøkelsen har vist at ST131 er den dominerende E. coli ESBL-A klonen i Norge assosiert til infeksjon og bærerskap [4, 5]. Blant ESBL-CARBA produserende E. coli har det derimot vært andre kloner som f.eks. ST167, ST38, ST69 og ST361 som har dominert. ST131 har vært en mindre vanlig klon.

ECDC-studien ble igangsatt etter en melding fra Danmark om en økning av OXA-244 produserende E. coli ST131. For å undersøke om dette var et nasjonalt eller internasjonalt fenomen ble referanselaboratorier i Europa bedt om å dele informasjon og genomsekvenser om situasjonen i de enkelte land. Totalt inngikk 594 genomsekvenser av ESBL-CARBA produserende E. coli ST131 og ST131 singel lokus varianter (f.eks. ST13730) fra 17 Europeiske land fra august 2012 til mai 2024 i analysen. Fra Norge inkluderte dette 13 isolater påvist i perioden 2012-2023.

OXA-244 og OXA-48 var de dominerende ESBL-CARBA variantene (76 %). Mens økningen av OXA-48 produserende ST131 var moderat over tid, økte OXA-244 produserende ST131 markant i perioden 2021-2023. OXA-244 har en aminosyre forskjell fra OXA-48 som medfører økt følsomhet for temocillin [6] og ledsagende diagnostiske utfordringer. K-res har tidligere informert om disse utfordringene (Viktig informasjon angående påvisning av OXA-244 karbapenemase-produserende E. coli). OXA-244 har vært mest koblet til ST38 som også har forårsaket utbrudd i Norge [7].

I ECDC-studien ble OXA-244 eller OXA-48 produserende ST131 påvist i henholdsvis 14 og 12 Europeiske land. Epidemiologisk informasjon var begrenset, men OXA-244 isolater var mer assosiert med kvinner og fra urin enn OXA-48 isolater.

E-coli ST131 kan genomisk deles inn i flere subkloner hvor subklon C1 og C2 har vært mest assosiert med ESBL-A, mens subklon A i hovedsak har vært mer antibiotikafølsom. I Norge har tidligere studier vist at subklon A har ekspandert mer enn subklon C1 og C2 [4], sannsynligvis på grunn av mindre bruk av ikke-penicillin β-laktamer enn i andre land [8]. I ECDC studien var OXA-244 assosiert mer med subklon A, mens OXA-48 og andre ESBL-CARBA varianter tilhørte mer subklon C2. 75 % av OXA-244 isolatene var i tillegg ESBL-A positiv, mens bare 21 % av OXA-48 isolatene hadde en ESBL-A.

Genetiske slektskapsanalyser med kjernegenom multilokus sekvenstyping (cgMLST) påviste 8 større klynger med mer enn ti isolater. Fem OXA-244 klynger ble påvist hvor hver klynge inneholdt isolater fra flere land. Fire av norske OXA-244 isolater ble påvist i to av disse klyngene. To OXA-48 klynger og en klynge med KPC ble påvist, men isolater i disse klyngene var i hovedsak fra ett land.

Studien konkluderer med at økningen av mulig samfunnservervet ESBL-CARBA produserende ST131 er bekymringsfull. K-res jobber nå med å se mer på økningen av spesielt OXA-244 i Norge.

Gå til studien 

Kontakt:

Referanser:

  1. Kohlenberg, A., et al., Emergence of Escherichia coli ST131 carrying carbapenemase genes, European Union/European Economic Area, August 2012 to May 2024. Euro Surveill, 2024. 29(47).
  2. Mathers, A.J., G. Peirano, and J.D. Pitout, Escherichia coli ST131: The quintessential example of an international multiresistant high-risk clone. Adv Appl Microbiol, 2015. 90: p. 109-54.
  3. Pitout, J.D. and R. DeVinney, Escherichia coli ST131: a multidrug-resistant clone primed for global domination. F1000Res, 2017. 6.
  4. Gladstone, R.A., et al., Emergence and dissemination of antimicrobial resistance in Escherichia coli causing bloodstream infections in Norway in 2002-2017: a nationwide, longitudional, microbial population genomic study. Lancet Microbe, 2021.
  5. Raffelsberger, N., et al., Community carriage of ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae: a cross-sectional study of risk factors and comparative genomics of carriage and clinical isolates. mSphere, 2023. 8(4): p. e0002523.
  6. Potron, A., et al., Characterisation of OXA-244, a chromosomally-encoded OXA-48-like β-lactamase from Escherichia coli. Int J Antimicrob Agents, 2016. 47(1): p. 102-3.
  7. Lindemann, P.C., et al., Intraregional hospital outbreak of OXA-244-producing Escherichia coli ST38 in Norway, 2020. Euro Surveill, 2023. 28(27).
  8. Pontinen, A.K., et al., Modulation of multidrug-resistant clone success in Escherichia coli populations: a longitudinal, multi-country, genomic and antibiotic usage cohort study. Lancet Microbe, 2024. 5(2): p. e142-e150.